La mini-série raconte les événements ayant conduits aux attaques du par Al-Qaïda, allant de l'attentat du de 1993 aux minutes après l'effondrement des tours du en 2001. Le film se base sur les rapports de la commission du 11 Septembre. Le film suit deux personnages principaux : John P. O'Neill et un agent fictif de la CIA, nommé Kirk. O'Neill était un expert de l'antiterrorisme travaillant au FBI qui fut tué dans l'effondrement des tours jumelles du après avoir été nommé chef de la sécurité du WTC. L'agent spécial de la CIA, Kirk, est vu en train de négocier avec plusieurs alliés des Américains, principalement avec le chef de l'Alliance du Nord, Ahmed Chah Massoud, en Afghanistan. Le film s'appuie donc sur des faits et évènements historiques, mais racontés par le biais de protagonistes fictifs.