Dans un village, Marie Fontaine est agent de police au côté de son collègue, l'Agent Tommy et sous les ordres du Commissaire Migraine, archétype de la mouche du coche. Elle est élevée par ses grands-parents, Papy et Mamy Fontaine, qui tiennent une confiserie. Grâce à Blip, invention de son papy Fontaine - située en arrière-boutique de la confiserie-, Marie Fontaine se transforme en Mega Mindy, héroïne qui lutte contre les malfrats qui s'attaquent au village. Le Commissaire Migraine s'attribue tous les mérites des faits d'armes de Mega Mindy, tout en minimisant son rôle, et Tommy en est amoureux, sans savoir que Marie et elle ne sont qu'une seule et même personne.