Cirkus Bukowsky raconte l'histoire de Nestor Bukowsky, un homme au destin malheureux, dont la petite amie se suicide, ce qui semble ensuite être un meurtre. Il perd son emploi, sa famille, son foyer et il est enquêté par un détective de police, Kuneš, un homme suivi par ses propres démons. Son patron avertit Kuneš de suivre une thérapie anti-alcool, alors il décide d'enquêter sur l'affaire par lui-même. Après un certain temps, ils réalisent tous deux qu'ils doivent unir leurs forces pour résoudre l'affaire.