Un sous-marin MSDF entre en collision avec un sous-marin nucléaire américain, écrasant les 76 personnes à bord, y compris son commandant, Shiro Kaieda. L'équipage survit. L'accident est une histoire de couverture pour obtenir l'équipage du sous-marin MSDF à bord du Seabat, un sous-marin nucléaire secrètement construit par les gouvernements japonais et américain. Cependant, Kaieda charge le Seabat de missiles nucléaires et subitement se mutine et s'enfuit.