Flynn et Alicia, les capitaines des navires pirates Aurora et Eldorado, viennent de terminer leurs études au lycée et se sont joints aux pirates pour lutter contre un objectif commun : le capitaine du trésor Baracuda, le pirate le plus terrible de toutes les mers. Flynn, avec l’aide de sa bande de pirates, veut rendre l’étoile de l’île Dolphin, un amulette de leur patrie, et Alicia, en dirigeant une équipe de monstres incroyables, cherche à prouver à son père qu’il est devenu un vrai pirate.