Il y a très longtemps, la tribu Gurongi terrorisait les jusqu'à ce qu'un guerrier appelé Kamen Rider Kuuga apparaisse et l'emporte sur les Gurongi, scellant leur chef dans une cave. De nos jours,un homme avec une multitude de talents appelé Yusuke Godai se retrouvé connecté à une ceinture mystérieuse trouvée dans la cave lors d'une fouille archéologique. Pendant ce temps, les Gurongi se retrouvent libres et reprennent le jeu meurtrier qu'ils jouent sur les descendants des Linto, l'humanité. Yusuke et la police vont devoir unir leurs efforts et maîtriser les pouvoirs de Kuuga pour combattre les Gurongi et protéger les humains. Alors que la lutte s'intensifie, Yusuke apprend qu'il y a un lien entre Kuuga et le chef des Gurongis.