Australie-Occidentale, été 1969. Le jeune Charlie est réveillé au beau milieu de la nuit par Jasper Jones, un adolescent mi-aborigène à la mauvaise réputation, qui vient frapper à sa fenêtre. Implorant l’aide de Charlie, Jasper le conduit dans la forêt et lui montre quelque chose qui changera sa vie à jamais. Charlie et Jasper vont devoir s’allier et affronter leurs peurs pour tenter d'élucider un mystère qui consume toute une communauté. Dans la petite ville isolée étouffée par les secrets, les ragots et les tragédies insoupçonnées qui se jouent derrière les façades coquettes, Charlie verra sa famille voler en éclats, éprouvera ses premiers émois amoureux, et découvrira ce qu’est le véritable courage.