L'intrigue de Darfur se focalise sur six journalistes occidentaux visitant un petit village au Darfour, dans l'ouest du Soudan, sous l'escorte d'une escouade de troupes de l'Union africaine, en mission de maintien de la paix. Quand ils apprennent que la junte brutale des Janjawids, soutenue par l'État, se dirige vers le village, ils sont confrontés à un terrible dilemme : quitter le Soudan et divulguer ces atrocités dans les médias, ou rester en risquant leurs vies dans l'espoir d'éviter un massacre assuré. Alors que la plupart d'entre eux s'enfuient vers le camp de base, deux journalistes, Freddie Smith, et Theo Schwartz, décident de rester derrière, soutenus par le Nigérian commandant de l'unité de l'UA, le Capitaine Jack Tobamke, pour tenter de sauver les villageois lorsque les Arabes Janjawids pénètrent dans le village et commencer à tuer indifféremment et sans la moindre pitié tous les Noirs africains — hommes, femmes, et enfants. En dépit de leurs efforts pour sauver les villageois, le Capitaine Tobamke, Theo, et Freddie sont tués un par un au cours de la fusillade avec les Janjawids, bien qu'ayant réussi à tuer ou blesser plusieurs soldats de la junte. Les Janjawid incendient le village et s'en vont, vraisemblablement à la recherche d'un autre village pour poursuivre leur virée génocidaire à travers le Darfour. La scène finale montre l'unique femme de l'équipe de journalistes, Malin Lausberg, qui avait fui avec la plupart des autres journalistes et des soldats de l'UA lors de l'attaque des Janjaouids, retournant le lendemain au village détruit, profondément désemparée en voyant que tout le monde est mort, y compris ses deux collègues. Mais elle trouve un enfant que Freddie Smith est parvenu à sauver en le protégeant avec le corps de Theo. Malin emporte l'enfant avec elle, quittant le village détruit avec les troupes de l'UA.