Pendant plusieurs années, un terrible monstre marin coule des navires de la Marine. Sur un petit nombre de navires qui ont réussi à survivre, on a découvert, sur les flancs, de gigantesques trous de forme triangulaire. Désormais, toute sortie en mer est mortelle, aussi l’Amérique envoie-t-elle une frégate spéciale appelée Blue Star. Son objectif est de retrouver et de détruire le terrible monstre. L’un des participants de l’expédition punitive est un célèbre professeur français, Pierre Aronnax. Il possède une connaissance approfondie des mystères des profondeurs marines. La recherche du monstre se poursuit pendant plus de trois mois, mais, à la fin, la frégate le détecte encore et enclenche immédiatement le mode d’attaque. Après un combat infructueux contre le navire du monstre, celui-ci sombre, et le professeur, son serviteur Conseil et le baleinier Ned Land montent à bord d’un sous-marin et entreprennent un incroyable voyage sous l’eau.