Dans un futur proche, la Zircon Corporation a créé la dernière génération de prison : la Chaise de l'Exil. Une machine capable de stocker les esprits tout en les dématérialisant du corps humain. Mais cette machine a un effet pervers, le monde où sont confinés les esprits, la Matrice, s'est métamorphosée en entité pour revenir dans le monde des vivants et détruire une ville entière. Une question se pose alors pour la Zircon Corporation : éliminer la matrice ou s'en servir comme arme ?