Musashi voit son rêve d'enfance devenir réalité. Il est désormais un astronaute. Mais quand il arrive sur la planète Juran, qui était supposée être une belle planète couverte de fleurs, il ne trouve rien d'autre qu'un vaste désert rouge. Soudainement attaqué par le monstre Scorpis, celui-là même qui changea la planète Juran en désert, il est sauvé in extremis par Ultraman Cosmos. Une fois de retour sur Terre, il part pour Saipan dans le but d'assister au mariage d'un vieil ami. Mais Scorpis apparaît de nouveau et se met à tout détruire ...