Marcell Nouilles (Marcell Toing en VA) est un rat, mais est aussi le chef le plus talentueux de Rio de Janeiro. C'est le propriétaire du restaurant « Ratanouille » avec ses trois "collègues", Carole, Greg et Octave, tous trois également des rats. Marcell, Carole et Greg sont chargés de voler des ingrédients dans les cuisines de restaurants humains pour les utiliser dans leurs plats. Cependant, les concurrents du restaurant de Marcell cherchent désespérément à découvrir le secret derrière la qualité de ses plats, risquant par la même occasion de mettre la clé sous la porte.