Mike est un jeune garçon solitaire qui erre sur la côte désertée de Coorong, en Australie-Méridionale, près de l'embouchure de la rivière Murray. Lui et son père reclus "Hide Away" Tom vivent dans des dunes de sable isolées face à l'océan Austral. En quête d'amitié, Mike rencontre un autre ermite dans ce désert, Fingerbone Bill, un aborigène éloigné de son peuple. Fingerbone nomme Mike "Storm Boy" et demande l'aide de l'enfant pour s'occuper de trois poussins pélicans orphelins. Alors que le père de Mike insiste pour qu'il relâche les oiseaux adultes dans la nature, un pélican en particulier, nommé «Mr Percival», revient. L'oiseau forme alors un lien profond avec le garçon.